Registrierung einer hochaufgelösten histologischen Schnittserie eines Rattenhirns

Oliver Schmitt; Jan Modersitzki

doi:10.1007/978-3-642-56714-8_31

Registrierung einer hochaufgelösten histologischen Schnittserie eines Rattenhirns

Institute of Mathematics

Abstract

Die dreidimensionale Darstellung von Bildfolgen, die auf makroskopischen oder mikroskopischen Serienscnnitten basieren, ist ein in der Anatomie häufig auftauchendes Problem. Die meist linear und nieht-linear deformierten urnfangreichen Bilddaten erfordern eine effiziente und morphologisch befriedigende Korrektur, urn anatomisch relevante 3D-Rekonstruktionen zu erzeugen. Urn eine mikroskopisch interessante Information zu erhalten, miissen histologische Schnitte hochaufgelöst digitalisiert werden. Es wurde ein Verfahren entwickelt, welches die Artefakt anfalligen hochaufgelösten Bilder effizient registriert, urn so einen hinreichenden Ausgangsunkt fur eine nicht-lineare elastische Registrierung zu erhalten. Die Ergebnisse verschiedener Parameter-Konfigurationen und eine Beurteilung der resultierenden 3D-Morphologie werden hier vorgestellt.

Original language	German
Title of host publication	Bildverarbeitung für die Medizin 2001
Editors	Heinz Handels, Alexander Horsch, Thomas Lehmann, Hans-Peter Meinzer
Number of pages	5
Place of Publication	Berlin, Heidelberg
Publisher	Springer Berlin Heidelberg
Publication date	01.01.2001
Pages	174-178
ISBN (Print)	978-3-540-41690-6
ISBN (Electronic)	978-3-642-56714-8
DOIs	https://doi.org/10.1007/978-3-642-56714-8_31
Publication status	Published - 01.01.2001
Event	Workshop on Bildverarbeitung fur die Medizin 2001 - Lübeck, Germany Duration: 04.03.2001 → 06.03.2001

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10.1007/978-3-642-56714-8_31

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doi = "10.1007/978-3-642-56714-8_31",

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editor = "Heinz Handels and Alexander Horsch and Thomas Lehmann and Hans-Peter Meinzer",

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}

Schmitt, O & Modersitzki, J 2001, Registrierung einer hochaufgelösten histologischen Schnittserie eines Rattenhirns. in H Handels, A Horsch, T Lehmann & H-P Meinzer (eds), Bildverarbeitung für die Medizin 2001. Informatik aktuell, Springer Berlin Heidelberg, Berlin, Heidelberg, pp. 174-178, Workshop on Bildverarbeitung fur die Medizin 2001, Lübeck, Schleswig-Holstein, Germany, 04.03.01. https://doi.org/10.1007/978-3-642-56714-8_31

Registrierung einer hochaufgelösten histologischen Schnittserie eines Rattenhirns. / Schmitt, Oliver; Modersitzki, Jan.
Bildverarbeitung für die Medizin 2001. ed. / Heinz Handels; Alexander Horsch; Thomas Lehmann; Hans-Peter Meinzer. Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, 2001. p. 174-178 ( Informatik aktuell).

Research output: Chapters in Books/Reports/Conference Proceedings › Conference contribution › peer-review

TY - GEN

T1 - Registrierung einer hochaufgelösten histologischen Schnittserie eines Rattenhirns

AU - Schmitt, Oliver

AU - Modersitzki, Jan

PY - 2001/1/1

Y1 - 2001/1/1

N2 - Die dreidimensionale Darstellung von Bildfolgen, die auf makroskopischen oder mikroskopischen Serienscnnitten basieren, ist ein in der Anatomie häufig auftauchendes Problem. Die meist linear und nieht-linear deformierten urnfangreichen Bilddaten erfordern eine effiziente und morphologisch befriedigende Korrektur, urn anatomisch relevante 3D-Rekonstruktionen zu erzeugen. Urn eine mikroskopisch interessante Information zu erhalten, miissen histologische Schnitte hochaufgelöst digitalisiert werden. Es wurde ein Verfahren entwickelt, welches die Artefakt anfalligen hochaufgelösten Bilder effizient registriert, urn so einen hinreichenden Ausgangsunkt fur eine nicht-lineare elastische Registrierung zu erhalten. Die Ergebnisse verschiedener Parameter-Konfigurationen und eine Beurteilung der resultierenden 3D-Morphologie werden hier vorgestellt.

AB - Die dreidimensionale Darstellung von Bildfolgen, die auf makroskopischen oder mikroskopischen Serienscnnitten basieren, ist ein in der Anatomie häufig auftauchendes Problem. Die meist linear und nieht-linear deformierten urnfangreichen Bilddaten erfordern eine effiziente und morphologisch befriedigende Korrektur, urn anatomisch relevante 3D-Rekonstruktionen zu erzeugen. Urn eine mikroskopisch interessante Information zu erhalten, miissen histologische Schnitte hochaufgelöst digitalisiert werden. Es wurde ein Verfahren entwickelt, welches die Artefakt anfalligen hochaufgelösten Bilder effizient registriert, urn so einen hinreichenden Ausgangsunkt fur eine nicht-lineare elastische Registrierung zu erhalten. Die Ergebnisse verschiedener Parameter-Konfigurationen und eine Beurteilung der resultierenden 3D-Morphologie werden hier vorgestellt.

UR - https://www.researchgate.net/publication/221272115_Registrierung_einer_hochaufgelosten_histologischen_Schnittserie_eines_Rattenhirns

U2 - 10.1007/978-3-642-56714-8_31

DO - 10.1007/978-3-642-56714-8_31

M3 - Konferenzbeitrag

SN - 978-3-540-41690-6

T3 - Informatik aktuell

SP - 174

EP - 178

BT - Bildverarbeitung für die Medizin 2001

A2 - Handels, Heinz

A2 - Horsch, Alexander

A2 - Lehmann, Thomas

A2 - Meinzer, Hans-Peter

PB - Springer Berlin Heidelberg

CY - Berlin, Heidelberg

T2 - Workshop on Bildverarbeitung fur die Medizin 2001

Y2 - 4 March 2001 through 6 March 2001

ER -

Registrierung einer hochaufgelösten histologischen Schnittserie eines Rattenhirns

Abstract

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