SALMON: Solvent accessibility, ligand binding, and mapping of ligand orientation by NMR spectroscopy

Christian Ludwig*, Paul J.A. Michiels, Xiaoqiu Wu, Kathryn L. Kavanagh, Ewa Pilka, Anna Jansson, Udo Oppermann, Ulrich L. Günther

*Korrespondierende/r Autor/-in für diese Arbeit
50 Zitate (Scopus)

Abstract

Quinone oxidoreductase 2 (NQO2) binds the prodrug tretazicar (also known as CB1954, 5-(aziridin-1-yl)-2,4-dinitrobenzamide), which exhibits a profound antitumor effect in human cancers when administered together with caricotamide. X-ray structure determination allowed for two possible orientations of the ligand. Here we describe a new NMR method, SALMON (solvent accessibility, ligand binding, and mapping of ligand orientation by NMR spectroscopy), based on waterLOGSY to determine the orientation of a ligand bound to a protein by mapping its solvent accessibility, which was used to unambiguously determine the orientation of CB1954 in NQO2.

OriginalspracheEnglisch
ZeitschriftJournal of Medicinal Chemistry
Jahrgang51
Ausgabenummer1
Seiten (von - bis)1-3
Seitenumfang3
ISSN0022-2623
DOIs
PublikationsstatusVeröffentlicht - 10.01.2008

Strategische Forschungsbereiche und Zentren

  • Forschungsschwerpunkt: Infektion und Entzündung - Zentrum für Infektions- und Entzündungsforschung Lübeck (ZIEL)

Fingerprint

Untersuchen Sie die Forschungsthemen von „SALMON: Solvent accessibility, ligand binding, and mapping of ligand orientation by NMR spectroscopy“. Zusammen bilden sie einen einzigartigen Fingerprint.

Zitieren