KFO 303, Teilprojekt: Funktionelle Charakterisierung und zielgerichtete Modulation des Hautmikrobioms in Pemphigoid-Erkrankungen

Das Hautmikrobiom spielt eine zunehmend anerkannte Rolle bei Immunität und lokalen Entzündungsreaktionen, und Veränderungen in diesen mikrobiellen Gemeinschaften werden im Zusammenhang mit chronisch entzündlichen Hauterkrankungen beobachtet. Während der ersten Förderperiode haben wir das Hautmikrobiom bei Patienten mit bullösem Pemphigoid (BP) charakterisiert und bakterielle Taxa identifiziert, die die Erkrankungswahrscheinlichkeit und/oder die Krankheitsaktivität beeinflussen. Im vorliegenden Antrag wollen wir die identifizierten Taxa weiter differenzieren und ihre Wirkung sowie die ihrer metabolischen Produkte auf die Ausbildung des BPs untersuchen. Für die detaillierte taxonomische Zuordnung und funktionelle Charakterisierung des Hautmikrobioms beim BP soll eine funktionelle metagenomische Analyse durchgeführt und die funktionelle Bedeutung der identifizierten Kandidatenbakterienspezies in einem Mausmodel der Pemphigoid-Erkrankungen getestet werden. Der Fokus liegt hierbei auf Kandidaten aus den Gattungen Staphylococcus und Propionibacterium. Für diese Gattungen wurden kurzkettige Fettsäuren als bakterielle Syntheseprodukte beschrieben, die den Krankheitsprozess modulieren könnten. Die spezifischen Ziele des Antrags umfassen (i) die Bestimmung der identifizierten Kandidatengattungen auf Speziesebene, (ii) die Untersuchung der funktionellen Bedeutung der identifizierten probiotischen Bakterien in einem Pemphigoid-Mausmodell und (iii) die Identifizierung funktioneller genomischer Unterschiede und Variationen auf Stammebene im Hautmikrobiom von BP-Patienten.