Kohlenhydrat-Protein-Komplexe: Ermittlung der Orientierung und des Bindungsepitops von Liganden im Komplex mit der humanen Blutgruppenglycosyltransferase B mit NMR

Projekt: DFG-ProjekteDFG Einzelförderungen

Projektdaten

Projektbeschreibung

Im Rahmen eines Forschungsfreisemesters sollen neue NMR-Verfahren zur Bestimmung des Bindungsepitops und der Orientierung von Kohlenhydratliganden in der Bindungstasche von Rezeptorproteinen etabliert werden. Als biologisch relevantes Beispiel dient hier die humane Blutgruppenglycosyltransferase B (GTB). Zunächst sollen qualitative Analysen von Bindungsepitopen mit Hilfe von Sättigungstransfer-Differenz-(STD)-NMR Experimenten durchgeführt werden. Die Studie soll darauf aufbauend die Möglichkeiten des quantitativen Epitop-Mappings mit NMR erweitern und gleichzeitig eine Analyse der Orientierung des Liganden in der Bindungstasche ermöglichen. Mit Hilfe von Computersimulationen soll auf der Basis experimenteller STD-NMR-Daten ein Docking der Liganden an die GTB durchgeführt werden. Die so erhaltenen Modelle sollen mit den Ergebnissen anderer NMR-Bindungsstudien etwa auf der Basis von sogenannten TROSY-Experimenten verglichen werden. Die Arbeiten zielen generell auf die Erweiterung des Spektrums von NMR-Experimenten zur Analyse von Ligandenbindung an Rezeptorproteine.
Statusabgeschlossen
Tatsächlicher Beginn/ -es Ende01.01.0431.12.05

UN-Ziele für nachhaltige Entwicklung

2015 einigten sich UN-Mitgliedstaaten auf 17 globale Ziele für nachhaltige Entwicklung (Sustainable Development Goals, SDGs) zur Beendigung der Armut, zum Schutz des Planeten und zur Förderung des allgemeinen Wohlstands. Die Arbeit dieses Projekts leistet einen Beitrag zu folgendem(n) SDG(s):

  • SDG 3 – Gesundheit und Wohlergehen

Strategische Forschungsbereiche und Zentren

  • Forschungsschwerpunkt: Infektion und Entzündung - Zentrum für Infektions- und Entzündungsforschung Lübeck (ZIEL)

DFG-Fachsystematik

  • 2.11-01 Biochemie