Rolf Hilgenfeld

2022

Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Peptidomimetic Aldehydes as Broad-Spectrum Inhibitors against Enterovirus and SARS-CoV-2

Dai, W., Jochmans, D., Xie, H., Yang, H., Li, J., Su, H., Chang, D., Wang, J., Peng, J., Zhu, L., Nian, Y., Hilgenfeld, R., Jiang, H., Chen, K., Zhang, L., Xu, Y., Neyts, J. & Liu, H., 24.02.2022, in: Journal of Medicinal Chemistry. 65, 4, S. 2794-2808 15 S.

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2021

The SARS-CoV-2 main protease M^pro causes microvascular brain pathology by cleaving NEMO in brain endothelial cells

Wenzel, J., Lampe, J., Müller-Fielitz, H., Schuster, R., Zille, M., Müller, K., Krohn, M., Körbelin, J., Zhang, L., Özorhan, Ü., Neve, V., Wagner, J. U. G., Bojkova, D., Shumliakivska, M., Jiang, Y., Fähnrich, A., Ott, F., Sencio, V., Robil, C. & Pfefferle, S. &26 mehr, Sauve, F., Coêlho, C. F. F., Franz, J., Spiecker, F., Lembrich, B., Binder, S., Feller, N., König, P., Busch, H., Collin, L., Villaseñor, R., Jöhren, O., Altmeppen, H. C., Pasparakis, M., Dimmeler, S., Cinatl, J., Püschel, K., Zelic, M., Ofengeim, D., Stadelmann, C., Trottein, F., Nogueiras, R., Hilgenfeld, R., Glatzel, M., Prevot, V. & Schwaninger, M., 11.2021, in: Nature Neuroscience. 24, 11, S. 1522-1533 12 S.

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The SARS-unique domain (SUD) of SARS-CoV and SARS-CoV-2 interacts with human Paip1 to enhance viral RNA translation

Lei, J., Ma-Lauer, Y., Han, Y., Thoms, M., Buschauer, R., Jores, J., Thiel, V., Beckmann, R., Deng, W., Leonhardt, H., Hilgenfeld, R. & von Brunn, A., 01.06.2021, in: The EMBO journal. 40, 11, S. e102277

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X-ray screening identifies active site and allosteric inhibitors of SARS-CoV-2 main protease

Günther, S., Reinke, P. Y. A., Fernández-García, Y., Lieske, J., Lane, T. J., Ginn, H. M., Koua, F. H. M., Ehrt, C., Ewert, W., Oberthuer, D., Yefanov, O., Meier, S., Lorenzen, K., Krichel, B., Kopicki, J.-D., Gelisio, L., Brehm, W., Dunkel, I., Seychell, B. & Gieseler, H. &82 mehr, Norton-Baker, B., Escudero-Pérez, B., Domaracky, M., Saouane, S., Tolstikova, A., White, T. A., Hänle, A., Groessler, M., Fleckenstein, H., Trost, F., Galchenkova, M., Gevorkov, Y., Li, C., Awel, S., Peck, A., Barthelmess, M., Schlünzen, F., Lourdu Xavier, P., Werner, N., Andaleeb, H., Ullah, N., Falke, S., Srinivasan, V., França, B. A., Schwinzer, M., Brognaro, H., Rogers, C., Melo, D., Zaitseva-Doyle, J. J., Knoska, J., Peña-Murillo, G. E., Mashhour, A. R., Hennicke, V., Fischer, P., Hakanpää, J., Meyer, J., Gribbon, P., Ellinger, B., Kuzikov, M., Wolf, M., Beccari, A. R., Bourenkov, G., von Stetten, D., Pompidor, G., Bento, I., Panneerselvam, S., Karpics, I., Schneider, T. R., Garcia-Alai, M. M., Niebling, S., Günther, C., Schmidt, C., Schubert, R., Han, H., Boger, J., Monteiro, D. C. F., Zhang, L., Sun, X., Pletzer-Zelgert, J., Wollenhaupt, J., Feiler, C. G., Weiss, M. S., Schulz, E.-C., Mehrabi, P., Karničar, K., Usenik, A., Loboda, J., Tidow, H., Chari, A., Hilgenfeld, R., Uetrecht, C., Cox, R., Zaliani, A., Beck, T., Rarey, M., Günther, S., Turk, D., Hinrichs, W., Chapman, H. N., Pearson, A. R., Betzel, C. & Meents, A., 07.05.2021, in: Science. 372, 6542, S. 642-646 5 S.

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2020

Crystal structure of SARS-CoV-2 main protease provides a basis for design of improved a-ketoamide inhibitors

Zhang, L., Lin, D., Sun, X., Curth, U., Drosten, C., Sauerhering, L., Becker, S., Rox, K. & Hilgenfeld, R., 24.04.2020, in: Science. 368, 6489, S. 409-412 4 S.

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515 Zitate (Scopus)

Processing of the SARS-CoV pp1a/ab nsp7-10 region

Krichel, B., Falke, S., Hilgenfeld, R., Redecke, L. & Uetrecht, C., 13.03.2020, in: Biochemical Journal. 477, 5, S. 1009-1019 11 S.

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21 Zitate (Scopus)

Profiling of flaviviral NS2B-NS3 protease specificity provides a structural basis for the development of selective chemical tools that differentiate Dengue from Zika and West Nile viruses

Rut, W., Groborz, K., Zhang, L., Modrzycka, S., Poreba, M., Hilgenfeld, R. & Drag, M., 03.2020, in: Antiviral Research. 175, 104731.

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3 Zitate (Scopus)

SARS-CoV-2 M^pro inhibitors and activity-based probes for patient-sample imaging

Rut, W., Groborz, K., Zhang, L., Sun, X., Zmudzinski, M., Pawlik, B., Wang, X., Jochmans, D., Neyts, J., Młynarski, W., Hilgenfeld, R. & Drag, M., 22.10.2020, in: Nature Chemical Biology.

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α-Ketoamides as Broad-Spectrum Inhibitors of Coronavirus and Enterovirus Replication: Structure-Based Design, Synthesis, and Activity Assessment

Zhang, L., Lin, D., Kusov, Y., Nian, Y., Ma, Q., Wang, J., Von Brunn, A., Leyssen, P., Lanko, K., Neyts, J., De Wilde, A., Snijder, E. J., Liu, H. & Hilgenfeld, R., 14.05.2020, in: Journal of Medicinal Chemistry. 63, 9, S. 4562-4578 17 S.

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96 Zitate (Scopus)

2017

Effects of NS2B-NS3 protease and furin inhibition on West Nile and Dengue virus replication

Kouretova, J., Hammamy, M. Z., Epp, A., Hardes, K., Kallis, S., Zhang, L., Hilgenfeld, R., Bartenschlager, R. & Steinmetzer, T., 01.01.2017, in: Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry. 32, 1, S. 712-721 10 S.

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4 Zitate (Scopus)

Lybatides from Lycium barbarum Contain An Unusual Cystine-stapled Helical Peptide Scaffold

Tan, W. L., Wong, K. H., Lei, J., Sakai, N., Tan, H. W., Hilgenfeld, R. & Tam, J. P., 01.12.2017, in: Scientific Reports. 7, 1, 5194.

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Peptide-Boronic Acid Inhibitors of Flaviviral Proteases: Medicinal Chemistry and Structural Biology

Nitsche, C., Zhang, L., Weigel, L. F., Schilz, J., Graf, D., Bartenschlager, R., Hilgenfeld, R. & Klein, C. D., 12.01.2017, in: Journal of Medicinal Chemistry. 60, 1, S. 511-516 6 S.

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10 Zitate (Scopus)

STD-NMR experiments identify a structural motif with novel second-site activity against West Nile virus NS2B-NS3 protease

Schöne, T., Grimm, L. L., Sakai, N., Zhang, L., Hilgenfeld, R. & Peters, T., 2017, in: Antiviral Research. 146, S. 174-183 10 S.

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2016

Coxsackievirus B3 protease 3C: Expression, purification, crystallization and preliminary structural insights

Fili, S., Valmas, A., Christopoulou, M., Spiliopoulou, M., Nikolopoulos, N., Lichière, J., Logotheti, S., Karavassili, F., Rosmaraki, E., Fitch, A., Wright, J., Beckers, D., Degen, T., Nénert, G., Hilgenfeld, R., Papageorgiou, N., Canard, B., Coutard, B. & Margiolaki, I., 01.12.2016, in: Acta Crystallographica Section:F Structural Biology Communications. 72, 12, S. 877-884 8 S.

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Crystal structure of zika virus ns2b-ns3 protease in complex with a boronate inhibitor

Lei, J., Hansen, G., Nitsche, C., Klein, C. D., Zhang, L. & Hilgenfeld, R., 29.07.2016, in: Science. 353, 6298, S. 503-505 3 S.

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59 Zitate (Scopus)

Irreversible inhibitors of the 3C protease of Coxsackie virus through templated assembly of protein-binding fragments

Becker, D., Kaczmarska, Z., Arkona, C., Schulz, R., Tauber, C., Wolber, G., Hilgenfeld, R., Coll, M. & Rademann, J., 28.09.2016, in: Nature Communications. 7, 12761.

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6 Zitate (Scopus)

p53 down-regulates SARS coronavirus replication and is targeted by the SARS-unique domain and PL ^pro via E3 ubiquitin ligase RCHY1

Ma-Lauer, Y., Carbajo-Lozoya, J., Hein, M. Y., Müller, M. A., Deng, W., Lei, J., Meyer, B., Kusov, Y., von Brunn, B., Bairad, D. R., Hünten, S., Drosten, C., Hermeking, H., Leonhardt, H., Mann, M., Hilgenfeld, R. & von Brunn, A., 2016, in: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. S. 5192-5201

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Structural and mutational analysis of the interaction between the Middle-East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) papain-like protease and human ubiquitin

Lei, J. & Hilgenfeld, R., 01.08.2016, in: Virologica Sinica. 31, 4, S. 288-299 12 S.

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8 Zitate (Scopus)

2015

Acquisition of new protein domains by coronaviruses: analysis of overlapping genes coding for proteins N and 9b in SARS coronavirus

Shukla, A. & Hilgenfeld, R., 01.01.2015, in: Virus Genes. 50, 1, S. 29-38 10 S.

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4 Zitate (Scopus)

A G-quadruplex-binding macrodomain within the "SARS-unique domain" is essential for the activity of the SARS-coronavirus replication-transcription complex

Kusov, Y., Tan, J., Alvarez, E., Enjuanes, L. & Hilgenfeld, R., 04.07.2015, in: Virology. 484, S. 313-322 10 S.

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8 Zitate (Scopus)

Antiviral activity of broad-spectrum and enterovirus-specific inhibitors against clinical isolates of enterovirus D68

Sun, L., Meijer, A., Froeyen, M., Zhang, L., Thibaut, H. J., Baggen, J., George, S., Vernachio, J., Van Kuppeveld, F. J. M., Leyssen, P., Hilgenfeld, R., Neyts, J. & Delang, L., 01.12.2015, in: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 59, 12, S. 7782-7785 4 S.

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16 Zitate (Scopus)

Identification of pyrazole derivative as an antiviral agent against chikungunya through HTVS

Jadav, S. S., Sinha, B. N., Pastorino, B., De Lamballerie, X., Hilgenfeld, R. & Jayaprakash, V., 2015, in: Letters in Drug Design and Discovery. 12, 4, S. 292-301 10 S.

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14 Zitate (Scopus)

Production, crystallization and X-ray diffraction analysis of the protease CT441 from Chlamydia trachomatis

Kohlmann, F., Shima, K., Rupp, J., Solbach, W., Hilgenfeld, R. & Hansen, G., 01.01.2015, in: Acta Crystallographica Section:F Structural Biology Communications. 71, S. 1454-1458 5 S.

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Structural basis of the proteolytic and chaperone activity of Chlamydia trachomatis CT441

Kohlmann, F., Shima, K., Hilgenfeld, R., Solbach, W., Rupp, J. & Hansen, G., 01.01.2015, in: Journal of Bacteriology. 197, 1, S. 211-218 8 S.

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3 Zitate (Scopus)

Structures of DegQ from Legionella pneumophila Define Distinct on and off States

Schubert, A., Wrase, R., Hilgenfeld, R. & Hansen, G., 17.08.2015, in: Journal of Molecular Biology. 427, 17, S. 2840-2851 12 S.

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4 Zitate (Scopus)

The enterovirus 3C protease inhibitor SG85 efficiently blocks rhinovirus replication and is not cross-resistant with rupintrivir

Lacroix, C., George, S., Leyssen, P., Hilgenfeld, R. & Neyts, J., 01.09.2015, in: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 59, 9, S. 5814-5818 5 S.

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6 Zitate (Scopus)

2014

Application of a cell-based protease assay for testing inhibitors of picornavirus 3C proteases

Van Der Linden, L., Ulferts, R., Nabuurs, S. B., Kusov, Y., Liu, H., George, S., Lacroix, C., Goris, N., Lefebvre, D., Lanke, K. H. W., De Clercq, K., Hilgenfeld, R., Neyts, J. & Van Kuppeveld, F. J. M., 01.03.2014, in: Antiviral Research. 103, 1, S. 17-24 8 S.

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3 Zitate (Scopus)

Crystal structure of the papain-like protease of MERS coronavirus reveals unusual, potentially druggable active-site features

Lei, J., Mesters, J. R., Drosten, C., Anemüller, S., Ma, Q. & Hilgenfeld, R., 01.01.2014, in: Antiviral Research. 109, 1, S. 72-82 11 S.

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31 Zitate (Scopus)

The capsid binder vapendavir and the novel protease inhibitor SG85 inhibit enterovirus 71 replication

Tijsma, A., Franco, D., Tucker, S., Hilgenfeld, R., Froeyen, M., Leyssen, P. & Neyts, J., 01.11.2014, in: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 58, 11, S. 6990-6992 3 S.

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19 Zitate (Scopus)

The enterovirus protease inhibitor rupintrivir exerts cross-genotypic anti-norovirus activity and clears cells from the norovirus replicon

Rocha-Pereira, J., Nascimento, M. S. J., Ma, Q., Hilgenfeld, R., Neyts, J. & Jochmansb, D., 01.01.2014, in: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 58, 8, S. 4675-4681 7 S.

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14 Zitate (Scopus)

Thiazolidone derivatives as inhibitors of chikungunya virus

Jadav, S. S., Sinha, B. N., Hilgenfeld, R., Pastorino, B., De Lamballerie, X. & Jayaprakash, V., 01.01.2014, in: European Journal of Medicinal Chemistry. 89, S. 172-178 7 S.

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18 Zitate (Scopus)

2013

3C protease of enterovirus 68: Structure-based design of michael acceptor inhibitors and their broad-spectrum antiviral effects against picornaviruses

Tan, J., George, S., Kusov, Y., Perbandt, M., Anemüller, S., Mesters, J. R., Norder, H., Coutard, B., Lacroix, C., Leyssen, P., Neyts, J. & Hilgenfeld, R., 01.04.2013, in: Journal of Virology. 87, 8, S. 4339-4351 13 S.

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34 Zitate (Scopus)

Development and Characterization of New Peptidomimetic Inhibitors of the West Nile Virus NS2B-NS3 Protease

Hammamy, M. Z., Haase, C., Hammami, M., Hilgenfeld, R. & Steinmetzer, T., 01.02.2013, in: ChemMedChem. 8, 2, S. 231-241 11 S.

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28 Zitate (Scopus)

Improving experimental phases for strong reflections prior to density modification

Uervirojnangkoorn, M., Hilgenfeld, R., Terwilliger, T. C. & Read, R. J., 01.10.2013, in: Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography. 69, 10, S. 2039-2049 11 S.

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4 Zitate (Scopus)

The structure of a glycoside hydrolase family 81 endo-β-1,3-glucanase

Zhou, P., Chen, Z., Yan, Q., Yang, S., Hilgenfeld, R. & Jiang, Z., 10.2013, in: Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography. 69, 10, S. 2027-2038 12 S.

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2012

Improved synthesis of rupintrivir

Lin, D., Qian, W., Hilgenfeld, R., Jiang, H., Chen, K. & Liu, H., 01.06.2012, in: Science China Chemistry. 55, 6, S. 1101-1107 7 S.

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2 Zitate (Scopus)

Single-drop optimization of protein crystallization

Meyer, A., Dierks, K., Hilterhaus, D., Klupsch, T., Mühlig, P., Kleesiek, J., Schöpflin, R., Einspahr, H., Hilgenfeld, R. & Betzel, C., 01.08.2012, in: Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications. 68, 8, S. 994-998 5 S.

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10 Zitate (Scopus)

Structural and mechanistic analysis of the membrane-embedded glycosyltransferase WaaA required for lipopolysaccharide synthesis

Schmidt, H., Hansen, G., Singh, S., Hanuszkiewicz, A., Lindner, B., Fukase, K., Woodard, R. W., Holst, O., Hilgenfeld, R., Mamat, U. & Mesters, J. R., 17.04.2012, in: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109, 16, S. 6253-6258 6 S.

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21 Zitate (Scopus)

Virus-host interactomes - Antiviral drug discovery

Ma-Lauer, Y., Lei, J., Hilgenfeld, R. & Von Brunn, A., 01.01.2012, in: Current Opinion in Virology. 2, 5, S. 614-621 8 S.

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22 Zitate (Scopus)

2011

Chemotherapeutic effects of bioassay-guided extracts of the American cockroach, Periplaneta americana

Wang, X. Y., He, Z. C., Song, L. Y., Spencer, S., Yang, L. X., Peng, F., Liu, G. M., Hu, M. H., Li, H. B., Wu, X. M., Zeng, S., Hilgenfeld, R., Stöckigt, J., Zhao, Y. & Qian, J. F., 09.2011, in: Integrative Cancer Therapies. 10, 3, S. NP12-NP23

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13 Zitate (Scopus)

Coronavirus nsp7-nsp8 complex formation

Seidel, H., Xiao, Y., Hilgenfeld, R. & Hübner, C. G., 01.07.2011, in: European Biophysics Journal with Biophysics Letters. 40, S. 221-222 2 S.

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Evidence for a two-metal-ion mechanism in the cytidyltransferase KdsB, an enzyme involved in lipopolysaccharide biosynthesis

Schmidt, H., Mesters, J. R., Wu, J., Woodard, R. W., Hilgenfeld, R. & Mamat, U., 08.08.2011, in: PLoS ONE. 6, 8, e23231.

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5 Zitate (Scopus)

Optimization of protein crystallization: The opticryst project

Garcia-Caballero, A., Gavira, J. A., Pineda-Molina, E., Chayen, N. E., Govada, L., Khurshid, S., Saridakis, E., Boudjemline, A., Swann, M. J., Shaw Stewart, P., Briggs, R. A., Kolek, S. A., Oberthuer, D., Dierks, K., Betzel, C., Santana, M., Hobbs, J. R., Thaw, P., Savill, T. J. & Mesters, J. R. &3 mehr, Hilgenfeld, R., Bonander, N. & Bill, R. M., 01.06.2011, in: Crystal Growth and Design. 11, 6, S. 2112-2121 10 S.

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11 Zitate (Scopus)

Peptide aldehyde inhibitors challenge the substrate specificity of the SARS-coronavirus main protease

Zhu, L., George, S., Schmidt, M. F., Al-Gharabli, S. I., Rademann, J. & Hilgenfeld, R., 01.11.2011, in: Antiviral Research. 92, 2, S. 204-212 9 S.

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20 Zitate (Scopus)

PhyloMap: An algorithm for visualizing relationships of large sequence data sets and its application to the influenza A virus genome

Zhang, J., Mamlouk, A. M., Martinetz, T., Chang, S., Wang, J. & Hilgenfeld, R., 20.06.2011, in: BMC Bioinformatics. 12, 1, S. 248-266 19 S.

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4 Zitate (Scopus)

Structural basis for the regulation of cysteine-protease activity by a new class of protease inhibitors in plasmodium

Hansen, G., Heitmann, A., Witt, T., Li, H., Jiang, H., Shen, X., Heussler, V. T., Rennenberg, A. & Hilgenfeld, R., 13.07.2011, in: Structure. 19, 7, S. 919-929 11 S.

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20 Zitate (Scopus)

The Legionella HtrA homologue DegQ is a self-compartmentizing protease that forms large 12-meric assemblies

Wrase, R., Scott, H., Hilgenfeld, R. & Hansen, G., 28.06.2011, in: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108, 26, S. 10490-10495 6 S.

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26 Zitate (Scopus)

The macromolecular complex of ICP and falcipain-2 from Plasmodium: Preparation, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis

Hansen, G., Schwarzloh, B., Rennenberg, A., Heussler, V. T. & Hilgenfeld, R., 01.11.2011, in: Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications. 67, 11, S. 1406-1410 5 S.

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1 Zitat (Scopus)

The SARS-Coronavirus-host interactome: Identification of cyclophilins as target for pan-Coronavirus inhibitors

Pfefferle, S., Schöpf, J., Kögl, M., Friedel, C. C., Müller, M. A., Carbajo-Lozoya, J., Stellberger, T., von Dall'Armi, E., Herzog, P., Kallies, S., Niemeyer, D., Ditt, V., Kuri, T., Züst, R., Pumpor, K., Hilgenfeld, R., Schwarz, F., Zimmer, R., Steffen, I. & Weber, F. &8 mehr, Thiel, V., Herrler, G., Thiel, H. J., Schwegmann-Weßels, C., Pöhlmann, S., Haas, J., Drosten, C. & von Brunn, A., 01.10.2011, in: PLoS Pathogens. 7, 10, e1002331.

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77 Zitate (Scopus)

The structure of the unliganded extracellular domain of the interleukin-6 signal transducer gp130 in solution

Lorenzen, I., Shang, W., Perbandt, M., Petoukhov, M. V., Svergun, D. I., Waetzig, G. H., Rose-John, S., Hilgenfeld, R. & Grötzinger, J., 01.06.2011, in: European Journal of Cell Biology. 90, 6-7, S. 515-520 6 S.

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2 Zitate (Scopus)

Hilgenfeld Rolf

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